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Un exemple de filière
Groupes Caractéristiques et commentaires Nombre estimé d'espèces
Bactéries Toujours présentes dans les composts et largement dominantes en qualité et en quantité. Forte croissance si Carbone / Azote bas et humidité élevée. Large spectre d'activité sur une large gamme de pH, surtout en substrats frais. Au minimum 800 à 1 000 espèces
Champignons Dominants si Carbone / Azote haut (dégradation des celluloses et lignines). Biomasse supérieure aux bactéries dans ces milieux. Ils sont capables de croître pour des taux d'humidité plus bas et tolèrent une large gamme de pH (de 2 à 9). Plusieurs dizaines de milliers d'espèces
Actinomycètes Attaquent les substances non dégradées par les Bactéries et les Champignons (chitine par exemple). Neutrophiles, ils tolèrent les pH légèrement basiques et sont peu compétitifs vis a vis des autres groupes. Ils se développent plutôt en conditions difficiles ou dans les phases finales de maturation. Les genres Streptomyces et Nocardia représentent 90% de leur biomasse. (Densité 3 à 15 fois plus faible que les Bactéries). Beaucoup d'odeurs aromatiques des sols ou composts mûrs sont dues aux Actinomycètes. Plusieurs dizaines d'espèces
Algues Organismes chlorophylliens, ils se cantonnent en surface et dans les dix premiers centimètres de la couche superficielle, en utilisant les sels minéraux. Un milieu humide est nécessaire dans une gamme de pH autour de la neutralité ou légèrement alcalin. En absence de lumière, (en dessous de 0,05% d'intensité lumineuse), ils peuvent devenir hétérotrophes. Plusieurs dizaines d'espèces
Protozoaires Grand groupe hétérogène d'unicellulaires mobiles. Ils réclament un milieu humide (eau interstitielle) et sont plus petits dans les composts que dans les eaux (manque d'espace vital). Grands consommateurs de bactéries (plusieurs dizaines de milliers dans la vie d'une cellule), éventuellement d'autres micro-organismes. Leur rôle écologique est mal connu. Plusieurs dizaines d'espèces
Cyanophycées Procaryotes proches des Bactéries, leur abondance coïncide généralement avec une activité des Bactéries. Les Cyanophycées sont fixatrices d'azote atmosphérique et sont aérobies. Plusieurs dizaines d'espèces

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